Egy szabadalmaztatott DNS alapú módszer

Egy szabadalmaztatott DNS alapú módszer

A Harmony Prenatális Teszt szabadalmaztatott DNS alapú technológiákon (DANSR™ és FORTE™) alapul.

  • A terhesség alatt a magzatból származó sejteken kívüli DNS – rövid DNS fragmentumok – kering az anyai vérben (cfDNS).
  • A Harmony segítségével a specifikus kromoszómákról (21, 18, 13, nemi kromoszómák) származó fragmentumok vizsgálhatók.1-2
  • A célzott analízis pontos triszómia-kockázatfelméréssel jár.3
DANSR célzott megközelítés (Deeper Analysis vs Random Sequencing)

DANSR célzott megközelítés (Deeper Analysis vs Random Sequencing)

Azokkal a tesztekkel szemben, ahol random módon az összes sejtmentes DNS-t (cell-free DNA, cfDNS) megszekvenálják, a Harmony teszt csak a keresett kromoszómák cfDNS-ére koncentrál.1 Ez az egyedi, irányított megközelítés lehetővé teszi a mélyebb analízist és végső soron pontosabb eredményekkel jár.1

Egyedi Microarray a DANSR Termékek Gyors és Pontos Kvantifikálásra

A microarray technológia a kvantifikálás egy jól bejáratott módja és használatos a prenatális genetikai diagnosztikai eljárásokban is. A Harmony Prenatális szűrő teszt a szabadalmaztatott célzott megközelítésének köszönhetően microarray technikát használ fel.5 A microarray technológia növeli a teszt hatékonyságát és sebességét.1

  • Jelentős időmegtakarítással jár a microarray használata a szekvenálással szemben; laboratóriumi átfutási idő akár három nap is lehet, de legfeljebb 5 nappal a minta laborba érkezése után.
  • A sikeresen elvégzett tesztek arányát emeli a robusztus microarray alapú kvantifikáció: a megfelelő minták 99%-a így eredményesen vizsgálható.5

A Magzati Frakció Pontos Mérései (FORTE)

  • A FORTE pontosan képes elkülöníteni a magas és az alacsony kockázatú eredményeket még alacsony magzati frakció esetén is.2,3
  • Magában foglalja az anyai kockázati faktorokat és a pontos magzati DNS méréseket 2,3
  • A célzott analízis pontos triszómia-kockázatfelméréssel jár.3
  • Minden páciensnek egyedi kockázati pontszámok
Harmony minta teszt jelentés Magzati cfDNS aránya: 10,5%
KROMOSZÓMA EREDMÉNY VALÓSZÍNŰSÉG JAVASLAT
21-es triszómia (T21) Magas kockázat Nagyobb, mint 99/100 (99%) Genetikai tanácsadás és további tesztelés
18-as triszómia (T21) Alacsony kockázat Kisebb, mint 1/10.000 (0.01%) Konzultáció a várandóssal
13-as triszómia (T21) Alacsony kockázat Kisebb, mint 1/10.000 (0.01%) Konzultáció a várandóssal
A Magzati Frakció Pontos Mérései (FORTE)

A Magzati Frakció Pontos Mérései (FORTE)

A FORTE Algoritmusa Magában Foglalja a Magzati DNS-sel Kapcsolatos Pontos Méréseket, az Anya Korát és a Terhességi Időt

FORTE Előnye

  • Tisztán elkülönülő magas és alacsony kockázatú eredmények4
  • Felülmúlja a Z-Statisztika alapú megközelítést4

A Harmony teszt célzott technológiája - DANSR

Kiválasztott régiók digitális analízise – DANSR (Digital Analysis of Selected Regions)

A DANSR-technológia specifikusan az érintett kromoszomák mély, irányított vizsgálatát célozza.6-7 Összehasonlításképp a kiterjedt (és költséges) teljes genom szekvenálásból származó adatok jelentős része nem releváns az aneuploidia szűrések szempontjából.8

Gyakorlatban a DANSR technológia a javítja a szűrés hatékonyságát, csökkenti a költségeket és biztosítja az optimális munkamenetet.6-7

DANSR MEGKÖZELÍTÉS

DANSR MEGKÖZELÍTÉS

FORTE Előnye

  • Több száz DANSR-analízis, amely az érintett kromoszomákat célozza.
  • Nincs hosszú és időigényes teljes genom adatgenerálás7

DANSR-TECHNOLÓGIA ELŐNYEI

  • Optimalizált munkamenet
  • Költséghatékonyság

A Magzati Frakció SNP (Single Nucleotide Polimorphism) analízise

Mivel a nem-invazív prenatális tesztek (Non-Invasive Prenatal Test, NIPT) nem képesek megbízható eredményekkel szolgálni olyan vérminták esetében, melyekben a magzati kromoszómafrakció kevesebb mint 4%,9 ezért a magzati frakció pontos felmérése elengedhetetlen.

A Harmony-teszt SNP-k segítségével elemzi ki és jellemzi a magzati frakciót minden minta esetében. Az SNP-k a leggyakoribb genetikai variációk egyének között, természetes előfordulásuk 1:300 nukleotid.10 E variációk meghatározása lehetővé teszi a magzati DNS frakció megbízható elkülönítését.

  • Több száz SNP elemzésén alapul
  • Minden mintában képesek elkülöníteni a magzati frakciót

Előnyök

  • Biztosítja, hogy megfelelő mennyiségű magzati frakció legyen a pontos NIPT-hez
  • Kizárja annak az esélyét, hogy a NIPT teszt eredménye az anyai cfDNS-en alapuljon

A magzati frakcióval kapcsolatos pontosság fontossága megmutatkozott, amikor kutatók két nem várandós nő mintáját küldték be nem-invazív prenatális szűrésre öt különböző laboratóriumba.12

1 páciens 2 páciens
LABORTESZT EREDMÉNY RÉSZLETEK EREDMÉNY RÉSZLETEK
Harmony teszt Nincs Nem elegendő magzati cfDNS Nincs Nem elegendő magzati cfDNS
Panorama Nincs Nincs valid eredmény alacsony magzati frakció (0.6%) miatt Nincs Nincs valid eredmény alacsony magzati frakció (0.6%) miatt
MaterniT21 Van 4,3% magzati frakció, negatív eredmény nőnemű magzatra Van 3,9% magzati frakció, negatív eredmény nőnemű magzatra
Illumina-alapú NIPT Van XX magzat, nincs mérhető aneuploidia Van XX magzat, nincs mérhető aneuploidia
Illumina-alapú NIPT Van XX magzat, nincs mérhető aneuploidia Van XX magzat, nincs mérhető aneuploidia

Ötből három laboratórium nőnemű magzatra vonatkoztatott negatív eredményt jelentett.

  • A kvantifikálás után Egy laboratórium túl alacsony koncentrációjúnak nyilvánította a magzati frakciót a NIPT elvégzéshez.
  • Csak a Harmony NIPT-t alkalmazó laboratórium jelentette helyesen nem elegendőnek a magzati frakciót a vizsgálat elvégzéséhez félrevezető eredmények nélkül.*

*Vak minták. Az NIPT Brandhez kötődő eredmények a leletezési sajátosságok alapján lettek megállapítva.

Egyedi Microarray Pontosság

A DANSR egy szabadalmaztatott analízismód, amely kifejezetten az érintett kromoszómák vizsgálatát célozza. Mint ilyen kiemelkedően jól képes kihasználni a microarray technológia nyújtotta előnyöket.

A microarray technológia felhasználása biztosítja a kromoszóma cfDNS-mérésekben tapasztalható variációk csökkenését, a magzati frakció pontosság növekedését, az alacsonyabb költségeket és az eredményhez szükséges idő rendkívüli csökkenését.9

MICROARRAY MEGKÖZELÍTÉS

MICROARRAY MEGKÖZELÍTÉS

  • Kétszeresére növelhető a kimutatás pontossága az új generációs szekvenáló technikákhoz képest
  • A magzati frakciót célzó SNP vizsgálat pontossága körülbelül 3-szorosára növelhető az új generációs szekvenáló technikákhoz képest

MICROARRAY MÓDSZER ELŐNYEI

  • Jelentősen növeli a vizsgálat pontosságát
  • Csökkenti a költségeket
  • Látványosan csökkenti a vizsgálati időt

FORTE ALGORITMUS

A FORTE a Harmony Prenatális teszt szabadalmaztatott statisztikai algoritmusa. A FORTE az AcfS szoftver részeként összesíti a páciensek egyedi tulajdonságait, mint a magzati frakció, az anya kora és a terhességi kor, hogy tisztán különbséget lehessen tenni magas és alacsony kockázatú eredmények között.6 Az általánosan alkalmazott Z-Statisztikával összevetve a FORTE statiszikailag szignifikánsabb különbségeket jelent a valós pozitív és a valós negatív eredmények között.7,9

FORTE MEGKÖZELÍTÉS

FORTE MEGKÖZELÍTÉS

  • A célzott analízis és a páciens tulajdonságai együtt egy egyedileg súlyozott valószínűségi mutatóhoz vezetnek6
  • A személyre szabott felmérés lehetővé teszi a magas és alacsony valószínűségű eredmények közötti jobb elkülönítést12

FORTE ELŐNYEI

  • Jobb elkülönítés az alacsony és magas kockázatú eredmények között, amely alacsony magzati frakció esetén is nagyobb bizonyosságot tesz lehetővé

Mi a Harmony? (Módszer és technológia)

  1. Sparks et al. Prenat Diagn. 2012 Jan;32(1):3-9.
  2. Sparks et al. Am J Obstet Gynecol. 2012 Apr;206(4):319.e1-9.
  3. Juneau et al. Fetal Diagn Ther. 2014;36(4):282-6.
  4. Ashoor G et al., Am J Obstet Gynecol. 2012 Apr;206(4):322.e1-5.
  5. Data on file.
  6. Sparks et al. Prenat Diagn. 2012 Jan;32(1):3-9.
  7. Juneau et al. Fetal Diagn Ther. 2014. 36(4)282-6.
  8. Jensen et al. PLoS One. 2013;8(3):e57381. 
  9. Ashoor et al. Ultrasound Obstet Gynecol. 2013 Jan; 41(1):26-32.
  10. https://ghr.nlm.nih.gov/primer/genomicresearch/snp. Accessed April 24, 2017.
  11. Takoudes and Hamar. Ultrasound Obstet Gynecol 2015; 14:112-116. 
  12. Ashoor et al. Am J Obstet Gynecol. 2012 Apr;206(4):322.e1-5.